Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms