Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD3A6NKT7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD3A6NKT7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD3A6NKT7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD3A6NKT7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD3A6NKT7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD3A6NKT7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD3A6NKT7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD3A6NKT7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD3A6NKT7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD3A6NKT7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD3A6NKT7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD3A6NKT7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD3A6NKT7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD3A6NKT7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD3A6NKT7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RGPD3A6NKT7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD3A6NKT7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD3A6NKT7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD3A6NKT7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD3A6NKT7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD3A6NKT7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD3A6NKT7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD3A6NKT7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD3A6NKT7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD3A6NKT7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD3A6NKT7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD3A6NKT7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD3A6NKT7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD3A6NKT7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD3A6NKT7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD3A6NKT7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD3A6NKT7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD3A6NKT7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD3A6NKT7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD3A6NKT7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD3A6NKT7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD3A6NKT7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms