Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
STRCP1A6NGW2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
STRCP1A6NGW2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
STRCP1A6NGW2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
STRCP1A6NGW2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
STRCP1A6NGW2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
STRCP1A6NGW2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
STRCP1A6NGW2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
STRCP1A6NGW2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
STRCP1A6NGW2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
STRCP1A6NGW2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
STRCP1A6NGW2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
STRCP1A6NGW2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
STRCP1A6NGW2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
STRCP1A6NGW2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
STRCP1A6NGW2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
STRCP1A6NGW2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
STRCP1A6NGW2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms