Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 APTX-203ENST00000379813 1121 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 OR7E37P-201ENST00000421076 897 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ATP5G1P4-201ENST00000430660 441 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 CCDC42-202ENST00000539522 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC242988.1-201ENST00000611044 714 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 WWP2-201ENST00000356003 4227 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 DCLK1-201ENST00000255448 5703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 SEMA4D-201ENST00000339861 4258 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 SLC22A24-202ENST00000417740 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AL022476.1-201ENST00000443063 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 MSRB3-201ENST00000308259 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC093690.1-201ENST00000418963 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 MYT1-205ENST00000622439 2140 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 NCAM1-202ENST00000401611 2510 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 PARVA-201ENST00000334956 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 MYBBP1A-202ENST00000381556 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 SCRN3-202ENST00000409673 1788 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 DENND1B-201ENST00000235453 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 TRIM62-201ENST00000291416 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 TTC30A-201ENST00000355689 5975 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 CFAP69-201ENST00000389297 3902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 XIAPP2-201ENST00000527404 1852 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 CS-202ENST00000542324 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 SKA3-203ENST00000400018 2745 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 MYO7A-203ENST00000409893 4050 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AL645944.2-201ENST00000641702 1953 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 DENND4C-205ENST00000434457 6718 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 SLC7A5-203ENST00000565644 3983 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 SENP3-EIF4A1-201ENST00000614237 3519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 COL14A1-202ENST00000297848 6466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 NTN4-202ENST00000344911 3152 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 DCTN1-227ENST00000633691 4160 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 C4orf50-201ENST00000324058 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 CD300LG-202ENST00000317310 2758 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 GPR176-202ENST00000543580 1755 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 KRT18P63-201ENST00000505463 979 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 MRPL51-205ENST00000543164 814 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 MRPL51-206ENST00000543703 441 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AL035448.1-201ENST00000439529 1831 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AP000350.6-201ENST00000609510 5637 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 VIT-205ENST00000404084 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 PPP2R2C-202ENST00000335585 4092 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ZNF587-202ENST00000419854 5731 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 BRF1-204ENST00000392557 3579 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 EPB41L2-216ENST00000527411 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 NEIL1-201ENST00000355059 3759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ATG16L1-205ENST00000392020 3213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 SNHG1-206ENST00000537925 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 HERC2P2-201ENST00000613386 5181 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 WDR78-201ENST00000371022 1520 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AL021408.2-201ENST00000624196 1544 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 DDX19B-201ENST00000288071 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 KIF23-207ENST00000559279 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 TENM3-204ENST00000511685 10896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 NFASC-201ENST00000339876 10333 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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