Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms