Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSX2IPQ9Y2D8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms