Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SCAF8Q9UPN6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAF8Q9UPN6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms