Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms