Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms