Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms