Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms