Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms