Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MTRF1LQ9UGC7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms