Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APEX2Q9UBZ4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms