Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXTL2Q9UBQ6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms