Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms