Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZG7

NINJ2, Ninjurin-2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ2Q9NZG7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NINJ2Q9NZG7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms