Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXC10Q9NYD6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
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