Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RHBDL2Q9NX52 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms