Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms