Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXD4L1Q9NU39 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L1Q9NU39 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms