Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.931e-7■■■■□ 25.8
DROSHAQ9NRR4 DAZAP1-203ENST00000585485 3943 ntTSL 218.53■□□□□ 0.561e-6■■■■□ 25.8
DROSHAQ9NRR4 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.652e-14■■■■□ 25.7
DROSHAQ9NRR4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.592e-14■■■■□ 25.7
DROSHAQ9NRR4 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.492e-14■■■■□ 25.7
DROSHAQ9NRR4 MROH1-208ENST00000532255 3905 ntTSL 215.68■□□□□ 0.12e-14■■■■□ 25.7
DROSHAQ9NRR4 MROH1-205ENST00000527552 5832 ntTSL 1 (best)14.48□□□□□ -0.092e-14■■■■□ 25.7
DROSHAQ9NRR4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.981e-6■■■■□ 25.7
DROSHAQ9NRR4 RAB11FIP3-203ENST00000434585 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.5■□□□□ 0.231e-6■■■■□ 25.7
DROSHAQ9NRR4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.427e-10■■■■□ 25.7
DROSHAQ9NRR4 ZNF514-203ENST00000447814 554 ntTSL 413.36□□□□□ -0.277e-10■■■■□ 25.7
DROSHAQ9NRR4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.873e-7■■■■□ 25.6
DROSHAQ9NRR4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.382e-13■■■■□ 25.6
DROSHAQ9NRR4 RABGAP1L-209ENST00000457696 1847 ntTSL 1 (best)21.34■■□□□ 1.012e-13■■■■□ 25.6
DROSHAQ9NRR4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 12e-13■■■■□ 25.6
DROSHAQ9NRR4 RABGAP1L-222ENST00000635248 3074 ntTSL 515.96■□□□□ 0.152e-13■■■■□ 25.6
DROSHAQ9NRR4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.916e-7■■■■□ 25.6
DROSHAQ9NRR4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.886e-7■■■■□ 25.6
DROSHAQ9NRR4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.726e-7■■■■□ 25.6
DROSHAQ9NRR4 MED16-212ENST00000607471 2004 ntTSL 1 (best)22.93■■□□□ 1.266e-7■■■■□ 25.6
DROSHAQ9NRR4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.156e-7■■■■□ 25.6
DROSHAQ9NRR4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.066e-7■■■■□ 25.6
DROSHAQ9NRR4 MED16-210ENST00000606248 3181 ntTSL 1 (best)19.4■□□□□ 0.76e-7■■■■□ 25.6
DROSHAQ9NRR4 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.586e-7■■■■□ 25.6
DROSHAQ9NRR4 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.476e-7■■■■□ 25.6
DROSHAQ9NRR4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.951e-7■■■■□ 25.5
DROSHAQ9NRR4 ZFPM1-202ENST00000562417 497 ntTSL 326.99■■□□□ 1.911e-6■■■■□ 25.5
DROSHAQ9NRR4 RPL22-203ENST00000465335 806 ntTSL 324.58■■□□□ 1.536e-6■■■■□ 25.5
DROSHAQ9NRR4 RPL22-205ENST00000471204 524 ntTSL 26.85□□□□□ -1.316e-6■■■■□ 25.5
DROSHAQ9NRR4 TRMT2A-216ENST00000487668 1040 ntTSL 528.06■■■□□ 2.081e-7■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 TRMT2A-206ENST00000444845 739 ntTSL 323.99■■□□□ 1.431e-7■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 CARMN-209ENST00000602315 2706 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.25e-8■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 SEC13-207ENST00000397105 883 ntTSL 231.97■■■□□ 2.711e-6■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.711e-6■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 SEC13-210ENST00000428626 567 ntTSL 324.37■■□□□ 1.491e-6■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 SEC13-213ENST00000445064 669 ntTSL 524.25■■□□□ 1.471e-6■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 SEC13-206ENST00000397102 582 ntTSL 324.19■■□□□ 1.461e-6■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 DPAGT1-210ENST00000481084 2343 ntTSL 224.17■■□□□ 1.461e-6■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.351e-6■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 SEC13-212ENST00000432213 594 ntTSL 422.63■■□□□ 1.211e-6■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 DPAGT1-219ENST00000640747 1813 ntTSL 521.94■■□□□ 1.11e-6■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 SEC13-211ENST00000431352 832 ntTSL 521.89■■□□□ 1.11e-6■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 DPAGT1-204ENST00000414373 1638 ntTSL 521.88■■□□□ 1.091e-6■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 SEC13-205ENST00000397101 592 ntTSL 221.74■■□□□ 1.071e-6■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 DPAGT1-209ENST00000472016 568 ntTSL 221.5■■□□□ 1.031e-6■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 SEC13-204ENST00000397099 555 ntTSL 421.42■■□□□ 1.021e-6■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.011e-6■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 DPAGT1-202ENST00000392834 1817 ntTSL 220.74■□□□□ 0.911e-6■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.871e-6■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.811e-6■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.811e-6■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 DPAGT1-207ENST00000460183 1058 ntTSL 219.65■□□□□ 0.741e-6■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 DPAGT1-218ENST00000640102 1195 ntTSL 518.6■□□□□ 0.571e-6■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.551e-6■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 DPAGT1-206ENST00000445653 583 ntTSL 317.37■□□□□ 0.371e-6■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 DPAGT1-205ENST00000442480 999 ntTSL 513.71□□□□□ -0.211e-6■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 SREBF2-205ENST00000463741 634 ntTSL 224.1■■□□□ 1.451e-13■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 STRN4-205ENST00000593979 675 ntTSL 427.65■■■□□ 2.022e-17■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 STRN4-215ENST00000597063 570 ntTSL 427.65■■■□□ 2.022e-17■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 STRN4-209ENST00000594704 913 ntTSL 521.87■■□□□ 1.092e-17■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 STRN4-203ENST00000435164 1551 ntTSL 221.37■■□□□ 1.012e-17■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 STRN4-220ENST00000600710 565 ntTSL 521.2■□□□□ 0.982e-17■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 STRN4-212ENST00000596012 560 ntTSL 420.08■□□□□ 0.82e-17■■■■□ 25.4
DROSHAQ9NRR4 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC3.53□□□□□ -1.848e-15■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 DVL1-203ENST00000472445 639 ntTSL 227.79■■■□□ 2.041e-6■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 UBALD1-204ENST00000588691 281 ntTSL 336.71■■■■□ 3.478e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.398e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.298e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.958e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.528e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.261e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 MGAT4B-212ENST00000520134 592 ntTSL 334.36■■■■□ 3.091e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 MGAT4B-221ENST00000523108 1080 ntTSL 534.36■■■■□ 3.091e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 MGAT4B-211ENST00000520019 831 ntTSL 334.36■■■■□ 3.091e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 MGAT4B-208ENST00000519616 522 ntTSL 533.6■■■□□ 2.971e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.391e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 MGAT4B-203ENST00000518168 1013 ntTSL 229.02■■■□□ 2.241e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 MGAT4B-217ENST00000521305 1213 ntTSL 528.79■■■□□ 2.21e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 CHTF18-206ENST00000461268 814 ntTSL 526.99■■□□□ 1.911e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 MGAT4B-222ENST00000523329 543 ntTSL 326.05■■□□□ 1.761e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.471e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.341e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.151e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 MGAT4B-210ENST00000519965 524 ntTSL 320.46■□□□□ 0.871e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 CHTF18-207ENST00000464728 4088 ntTSL 219.29■□□□□ 0.681e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.651e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 CHTF18-208ENST00000471202 4494 ntTSL 218.2■□□□□ 0.51e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 TAOK1-205ENST00000583121 526 ntTSL 314.83□□□□□ -0.047e-10■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.967e-10■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 KRTCAP2-206ENST00000487350 785 ntTSL 1 (best)33.2■■■□□ 2.92e-6■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.427e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.197e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.782e-6■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.617e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 KRTCAP2-205ENST00000482246 414 ntTSL 324.54■■□□□ 1.522e-6■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.397e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.187e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.022e-6■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 TMEM91-206ENST00000447302 721 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.697e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 KRTCAP2-204ENST00000471891 578 ntTSL 319.08■□□□□ 0.652e-6■■■■□ 25.3
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