Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BATF3Q9NR55 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms