Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD87

C6orf50, Putative uncharacterized protein C6orf50, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf50Q9HD87 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C6orf50Q9HD87 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C6orf50Q9HD87 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C6orf50Q9HD87 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C6orf50Q9HD87 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C6orf50Q9HD87 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C6orf50Q9HD87 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C6orf50Q9HD87 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C6orf50Q9HD87 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C6orf50Q9HD87 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C6orf50Q9HD87 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C6orf50Q9HD87 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C6orf50Q9HD87 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C6orf50Q9HD87 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C6orf50Q9HD87 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C6orf50Q9HD87 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C6orf50Q9HD87 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C6orf50Q9HD87 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C6orf50Q9HD87 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C6orf50Q9HD87 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C6orf50Q9HD87 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C6orf50Q9HD87 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C6orf50Q9HD87 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C6orf50Q9HD87 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C6orf50Q9HD87 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C6orf50Q9HD87 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C6orf50Q9HD87 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C6orf50Q9HD87 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms