Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOJQ9H4E5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOJQ9H4E5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOJQ9H4E5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOJQ9H4E5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOJQ9H4E5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOJQ9H4E5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOJQ9H4E5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOJQ9H4E5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOJQ9H4E5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOJQ9H4E5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOJQ9H4E5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOJQ9H4E5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOJQ9H4E5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOJQ9H4E5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOJQ9H4E5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms