Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms