Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM55Q9BYV6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms