Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY50

SEC11C, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11CQ9BY50 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEC11CQ9BY50 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEC11CQ9BY50 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms