Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC106Q9BWC9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms