Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms