Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms