Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms