Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPOCK3Q9BQ16 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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