Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms