Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GL2Q99962 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3GL2Q99962 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms