Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms