Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms