Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms