Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms