Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms