Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms