Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZC2HC1AQ96GY0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZC2HC1AQ96GY0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZC2HC1AQ96GY0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZC2HC1AQ96GY0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZC2HC1AQ96GY0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZC2HC1AQ96GY0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZC2HC1AQ96GY0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZC2HC1AQ96GY0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZC2HC1AQ96GY0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZC2HC1AQ96GY0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZC2HC1AQ96GY0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZC2HC1AQ96GY0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZC2HC1AQ96GY0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZC2HC1AQ96GY0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZC2HC1AQ96GY0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms