Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms