Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms