Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms