Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF3AQ92664 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms