Protein–RNA interactions for Protein: Q92621

NUP205, Nuclear pore complex protein Nup205, humanhuman

Predictions only

Length 2,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP205Q92621 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP205Q92621 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP205Q92621 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP205Q92621 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP205Q92621 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP205Q92621 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP205Q92621 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP205Q92621 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP205Q92621 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP205Q92621 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP205Q92621 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP205Q92621 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP205Q92621 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP205Q92621 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP205Q92621 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP205Q92621 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP205Q92621 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP205Q92621 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP205Q92621 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP205Q92621 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms