Protein–RNA interactions for Protein: Q92611

EDEM1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM1Q92611 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDEM1Q92611 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDEM1Q92611 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EDEM1Q92611 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EDEM1Q92611 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDEM1Q92611 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDEM1Q92611 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDEM1Q92611 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDEM1Q92611 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDEM1Q92611 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDEM1Q92611 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDEM1Q92611 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDEM1Q92611 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDEM1Q92611 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDEM1Q92611 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDEM1Q92611 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDEM1Q92611 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDEM1Q92611 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDEM1Q92611 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDEM1Q92611 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDEM1Q92611 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDEM1Q92611 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDEM1Q92611 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDEM1Q92611 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDEM1Q92611 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms