Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms