Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP2Q8WWK9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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