Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMO7Q8WWI1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms